<html xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
<meta name="Generator" content="Microsoft Word 15 (filtered medium)">
<style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:"Cambria Math";
        panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Verdana;
        panose-1:2 11 6 4 3 5 4 4 2 4;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0in;
        font-size:11.0pt;
        font-family:"Calibri",sans-serif;}
span.EmailStyle19
        {mso-style-type:personal-compose;
        font-family:"Calibri",sans-serif;
        color:windowtext;}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;
        font-family:"Calibri",sans-serif;}
@page WordSection1
        {size:8.5in 11.0in;
        margin:1.0in 1.0in 1.0in 1.0in;}
div.WordSection1
        {page:WordSection1;}
--></style>
</head>
<body lang="EN-US" link="#0563C1" vlink="#954F72" style="word-wrap:break-word">
<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal">I was playing with RDKIT the other day, and it wasn’t obvious how to get a scalar quantity of plausibility of a molecule.   It seems a SMILES string is right or wrong, and then maybe there are some warnings that can be trapped.   However,
 the benefits for search or fair sampling are different than the needs of correctness checks, which is deeper property.   That isn’t quite a fit to the music example where aesthetic considerations are subjective.<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<div style="border:none;border-top:solid #E1E1E1 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in">
<p class="MsoNormal"><b>From:</b> Friam <friam-bounces@redfish.com> <b>On Behalf Of
</b>Jon Zingale<br>
<b>Sent:</b> Tuesday, October 12, 2021 12:11 PM<br>
<b>To:</b> friam@redfish.com<br>
<b>Subject:</b> Re: [FRIAM] Schwill Rock?<o:p></o:p></p>
</div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:12.0pt;font-family:"Verdana",sans-serif;color:#333333">"</span><span style="font-size:12.0pt;font-family:"Arial",sans-serif;color:black">I mean from the perspective of aesthetics. Understanding why Pandora is messing
 it up means sampling the deep wells."</span><span style="font-size:12.0pt;font-family:"Verdana",sans-serif;color:#333333"><o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:12.0pt;font-family:"Verdana",sans-serif;color:#333333"><o:p> </o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:12.0pt;font-family:"Arial",sans-serif;color:black">Yes, but not more than one has to. This is why I am advocating for methods like a weighted ensemble. The working analogy for me comes from drug discovery. It doesn't
 make a lot of sense to probe the same old sites and the same old conformations.</span><span style="font-size:12.0pt;font-family:"Verdana",sans-serif;color:#333333"><o:p></o:p></span></p>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>